Кролики имеют своеобразное строение зубов. У них нет клыков, а резцы длинные, изогнутые, глубоко входят в зубные лунки. У новорожденного крольчонка 16 молочных зубов, у взрослого - 28 постоянных зубов. Зубы у кроликов отрастают постоянно и стачиваются наискось. При неправильной постановке зубов (когда они не сходятся) необходимо их подрезать, иначе животное может погибнуть.
Желудок у кроликов однокамерный. Желудочный сок имеет повышенную кислотность, что способствует хорошей переваримости корма. Пища через желудок проходит примерно в течение 72 ч. Кишечник у кроликов сравнительно длинный (в 8-10 раз превышает длину тела).
Особенностью кроликов является капрофагия - поедание мягкого ночного кала, в котором содержится протеин (около 28,5%) и значительное количество витаминов группы В.